Institute for Ophthalmic Research

Institut für Augenheilkunde

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1 PhD position - in ProgRET - Marie Skłodowska-Curie Doctoral Network

In the frame of an European Training Program to Understand, Diagnose and Treat Autosomal Dominant Retinal Diseases (ProgRET - Marie Skłodowska-Curie Doctoral Network, 2024-2027), we at Institute for Ophthalmic Research in Tübingen are offering 1 PhD position. If you are passionate about vision research and eager to explore interdisciplinary opportunities, we welcome applications from driven and talented individuals (with a Master’s degree at time of recruitment) who are ready to make a significant impact!

Title and Description of your Project:

Allele-specific, mutation-independent rescue of dominant negative acting IRD mutations by single gRNA-Cas variant genome editing (Ref. #DC9)

Supervisor: Dr. Susanne Kohl
Host institute: Institute for Ophthalmic Research at University of Tübingen, Germany
Secondments planned: Gulliver Biomed, Belgium; Institute for Neurosciences of Montpellier, France
Doctoral program: Mathematics-Natural Sciences at Eberhard Karls Universität Tübingen
Anticipated starting date: as soon as possible

Contact: simone.dusseljee[at]radboudumc.nl
CC: susanne.kohl[at]uni-tuebingen.de

Introduction to the project: Certain pathogenic variants in known inherited retinal disease related genes are known to cause autosomal dominant disease by gain-of-function pathomechanism. We anticipate to rescue the phenotype by specifically disrupting the aberrant allele via genome editing strategies. Specifically, we will focus on an allele-specific but mutation-independent design to overcome mutational heterogeneity. Within our research group we have identified frequent SNPs in these genes that are also commonly found heterozygously in the general population.

Your Task: as PhD student, you will develop a cell-based reporter assay to unbiasedly screen for potent and specific gRNAs and Cas variants, and will effectively target such SNPs in cis with the respective mutation. You will apply and further develop small and specific synthetic genome editing molecules that will be bioengineered to result in robust mutant allele-specific gene disruption, hereby leaving the wild-type allele of the gene intact.

Objective: By shutting off the production of mutant protein, the project aims to rescue the disease phenotype in patient-derived cellular models and/or retinal organoids using clinically viable delivery tools (i.e. AAV particles).

Further Information about the ProgRET Doctoral Training Network clicking the following link: www.progret.eu

22-12-2023

Projektkoordinatorin / Projektkoordinator (w/m/d) in Teilzeit (75 %) und befristet

Please download the full position description here

Das Universitätsklinikum Tübingen ist ein führendes Zentrum der deutschen Hochschulmedizin. Jährlich werden etwa 75.000 Patientinnen und Patienten stationär und ca. 380.000 ambulant behandelt. Mit rund 10.600 Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern ist es der größte Arbeitgeber der Region. Die Qualität der Krankenversorgung ist mit dem Gütesiegel der KTQ zertifiziert.

Wir suchen für das Forschungsinstitut für Augenheilkunde zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine/einen

Projektkoordinatorin / Projektkoordinator (w/m/d)
in Teilzeit (75 %) und befristet.

Das Department für Augenheilkunde am Universitätsklinikum Tübingen ist ein europaweit führendes Zentrum in der Erforschung und Behandlung von erblich bedingten Erkrankungen der Netzhaut, die zur Erblindung führen. Wir haben uns zum Ziel gesetzt neue Behandlungsansätze mittels Gentherapie und pharmakologischen Therapien zu entwickeln, die das Fortschreiten einer Erblindung verzögern oder zum Einhalt bringen. Für das anspruchsvolle Projekt suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine Persönlichkeit, die Erfahrungen im Bereich Medizinwissenschaften sowie Erfahrungen im professionellen Management komplexer Entwicklungsprojekte für Arzneistoffe in einem regulierten Umfeld (GxP) mitbringt.

Im Rahmen Ihrer Tätigkeit erwarten Sie folgende Aufgaben:

Durchführung und Koordination eines Projektes für die Entwicklung eines pharmakologischen Ansatzes zur Behandlung von erblichen Netzhauterkrankungen im Rahmen eines anspruchsvollen F&E-Programms. Wissenschaftliche Begleitung vom Labor bis hin zu einer klinischen Studie Phase I/II.

Agiles Projektmanagement und Koordination des Entwicklungsprojektes in Abstimmung und Interaktion mit den anderen Teilprojekten des Gesamtprogramms.

Abstimmung der Projektdurchführung mit dem Team und dem/der wissenschaftlichen Leiter/-in (Principal Investigator) des Teilprojektes sowie regelmäßige Berichterstattung an die Leitung des Gesamtprogramms.

Umsetzung von detaillierten Qualitätsmanagementprozessen, Risikomanagement und GxP-konformer Dokumentation in Vorbereitung auf die klinische Entwicklungsphase.

Evaluierung geeigneter externer Auftragshersteller (CMOs), die unter Good Manufacturing Practice (GMP)- Wirkstoffe/Formulierungen für das Projekt herstellen.

Planung und Übersicht über Qualitätskontrolle, Formulierungsentwicklung und präklinische Testungen der Wirkstoffe.

Was Sie mitbringen:

Abgeschlossenes naturwissenschaftliches Studium und Promotion in Biologie, Biochemie, Pharmakologie, Medizin oder einem vergleichbaren Studiengang.

Erfahrung in der translationalen Entwicklung von Wirkstoffen von der Discovery, über die Präklinik bis zur klinischen Entwicklung in einem regulierten Umfeld (GCP, GLP, GMP).

Freude an agilem Projektmanagement, Organisieren und strukturiertem Arbeiten in komplexen naturwissenschaftlichen Projekten in einem großen Team von Medizinern/Medizinerinnen und Naturwissenschaftlern/Naturwissenschaftlerinnen.

Praktische Erfahrung in der Arbeit im Rahmen von Qualitätsmanagementsystemen, Grundverständnis von Risikomanagement und „Regulatory Affairs“ für die Arzneimittelentwicklung.

Erfahrung mit der strukturierten Arbeitsweise der industriellen Wirkstoffforschung und -entwicklung.

Fundierte Fachkenntnisse in Pharmakologie, Toxikologie und molekularer Pathogenese.

Hohe Teamfähigkeit und Kommunikationsfähigkeit auch in Englisch.

Was Sie erwartet:

Sie werden Mitglied eines engagierten Teams von Kolleginnen und Kollegen aus Naturwissenschaft und Medizin, welches es sich zum Ziel gesetzt hat, eine zurzeit zur Blindheit führende Erkrankung behandelbar zu machen. Damit tragen Sie wesentlich zum Gelingen eines einzigartigen Projektes bei und leisten damit eine sinnstiftende Arbeit für ein besseres Leben mit einer schweren Erkrankung. Sie erhalten ein hohes Maß an Verantwortung bei flexiblem Arbeiten auch in Teilzeit, zum Beispiel auch bei Neueinstieg in eine berufliche Karriere nach Elternzeit.

Wir wenden den Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst der Länder (TV-L) an, Schwerbehinderte werden bei gleicher Eignung vorrangig berücksichtigt. Da die Universität Tübingen eine Erhöhung des Anteils von Frauen beim wissenschaftlichen Personal anstrebt, werden Frauen nachdrücklich aufgefordert, sich zu bewerben. Vorstellungskosten können leider nicht übernommen werden. Wir bitten um Beachtung der geltenden Impfregelungen. Die Anstellung erfolgt auf Grundlage der einschlägigen hochschulrechtlichen Bestimmungen.

Kontakt bei Fragen:

Herr Prof. Dr. Marius Ueffing
marius.ueffing@uni-tuebingen.de

Bewerbungsfrist: 31.01.2024

Wir freuen uns auf die Bewerbung mit Lebenslauf und Motivationsschreiben an
Frau Dr. Emanuela De Luca unter Angabe der Kennziffer 3754.
emanuela.de.luca@med.uni-tuebingen.de

Wir bitten auch um Mitteilung der Gehaltsvorstellung sowie des möglichen Eintrittstermins.

22-11-2023

Experienced Researcher (Postdoc) position

GENERAL INFORMATION  (Full Position Announcement as PDF to download )

The Institute for Ophthalmic Research (IOR) at the Centre for Ophthalmology in Tübingen, Germany is one of Europe´s largest institutions in the field of vision research, with a focus on the development of novel treatments for inherited retinal degeneration (RD). RD-type diseases are an important cause of blindness and remain largely untreatable to this day. We now invite applications for an Experienced Researcher (M.D. or PhD) with a background in biochemistry, neuroscience, cell biology, pharmacology, or related disciplines. The position is funded for a total duration of 4.5 years. The researcher will be part of a large, multi-disciplinary clinical research and drug development team located at the Centre for Ophthalmology. The work will focus on a novel class of pharmaceutical compounds with strong neuroprotective properties in blinding RD-type diseases. The candidate should be passionate for contributing to the translation of the compound into clinical application and thereby help to develop a treatment option for affected patients.  

PROJECT DESCRIPTION

You will be concerned with the pre-clinical and clinical development of novel cyclic nucleotide analogues and appropriate drug delivery technology. This includes the testing of compound preparations and their formulations on in vitro and in vivo models for retinal degeneration. Analysis methods include the evaluation of cell death markers, biochemical processes associated with retinal degeneration (activities of kinases, phosphatases, proteases, epigenetic processes), and functional assessments, including via electrophysiological methods. Building on the results obtained, further studies may address the development of novel biomarkers for retinal neurodegeneration.

You should furthermore engage in the design, monitoring, and evaluation of pre-clinical studies to be performed according to good-laboratory-practice (GLP). Finally, you may participate in the preparation of regulatory documentation for phase I/II clinical trials and the corresponding interactions with regulatory authorities in Germany. The work will be performed in a collaborative project with partners from academia and industry, located across Europe.

RESEARCH FIELD

Translational medical research

CONTRACT DETAILS

TYPE OF CONTRACT: temporary, 4.5 years

STATUS: Full-time

Hours per week: 38,5 h

ADDITIONAL INFORMATION

Benefits: We offer a salary according to the collective agreement for public service in Germany; including health care, unemployment, and retirement benefits. The IOR boasts modern state-of-the-art laboratories, facilities, and equipment. Also offered are training activities at the University of Tübingen graduate school for cellular and molecular neuroscience, as well as travels to international collaboration partners and conferences.

APPLICATION DETAILS

ENVISAGED JOB STARTING DATE: 01/03/2024

APPLICATION DEADLINE: 15/01/2024

HOW TO APPLY:

by mail or e-mail to:

Research Management Unit, Institute for Ophthalmic Research

Elfriede-Aulhorn-Str.7.,72076 Tübingen, Germany

Dr. Emanuela De Luca: emanuela.de.luca[at]med.uni-tuebingen.de

or Dr. Sigrid Diether: sigrid.diether@uni-tuebingen.de

For further Information on the position, contact Prof. François Paquet-Durand via

email address: francois.paquet-durand[at]uni-tuebingen.de  or

telephone +49 7071 2987430

20-09-2023

Bachelor/Master's thesis positions available on the ciliary role in signaling and degenerative processes

The Institute for Ophthalmic Research (www.eye-tuebingen.de/ueffinglab/) and the Core Facility for Medical Bioanalytics are part of the Centre for Ophthalmology. Gene editing is used to modify ciliated cells for downstream analysis using affinity proteomics and mass spectrometry, high-resolution fluorescence microscopy, RNA and protein expression analysis (qPCR, Western blot). Our focus is to elucidate how gene variants and mutations affect protein complexes, cilia and cilia-dependent signaling and thereby cause disease. We can offer to work in a team of highly motivated scientists, a stimulating atmosphere and access to advanced technical infrastructure.

Neurodevelopmental abnormalities, retinal degeneration, obesity, skeletal malformations and polycystic kidney disease, result in life-long disability and are a major feature of inherited ciliopathy disorders, caused by mutations in ciliary proteins. Cilia are evolutionarily conserved organelles found on most cell surfaces,and play key signaling roles to regulate diverse cellular processes during development and to maintain tissue homeostasis.
As an example, a specific subset of ciliary proteins that are involved in ciliopathies, are localized to the transition zone, a compartment at  the proximal region of the cilium. The loss of these components can disrupt the control of protein entry and exit from the cilium. This affects the regulation of cellular signaling cascades and even the control of the cell cycle.
In addition, post-translational modifications like phosphorylation and ubiquitinylation influence cilia protein composition and function. Utilizing CRISPR/Cas mediated knockout or knockin cells, and ectopic expression of wildtype and mutant proteins, defects induced by protein dysfunction are investigated in our lab. In lab meetings and seminars, project plans and results are discussed. As several projects are available interested students might have the chance to choose between topics and will be closely supervised by the person responsible for the related project.   

Please address inquiries to Dr. Karsten Boldt (karsten.boldt[at]uni-tuebingen.de) or Dr. Tina Beyer (tina.beyer[at]uni-tuebingen.de), Institute for Ophthalmic Research, the University Hospital in Tübingen.

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24-05-2023

PhD student (f/m/d) – Neuroscience, Ophthalmology Group of Prof. Marius Ueffing

We are looking for a PhD student (f/m/d) – Neuroscience, Ophthalmology
Group of Prof. Marius Ueffing , Kennz. 2835
Please for information about this position and how to apply click here on this link or download here the PDF with the description and the application procedures